1949年11月20日，代总统李宗仁丢下他的政府和文武百官，带着少量亲随到了香港，旋于12月5日飞往美国纽约就医。蒋介石带着残兵败将蛰居台湾，尽管仍挂着“中华民国”的旗号，却缺了个合法的“总统”。蒋遂故作姿态，接二连三地向在美国看病的李宗仁宣告“促归”函电，并派专人赴美劝驾，敦促李宗仁返台“主政”。李勃然回绝后，蒋介石乃刻不容缓地于1950年3月1日在台北宣告“复行视事”，从头登上“中华民国总统”宝座。陈诚顶替阎锡山任“行政院长”，黄少谷任“行政院”秘书长，吴国桢继任“台湾省主席”，俞大维任“国防部长”，周至柔任顾问总长，蒋经国任“国防部”政治部主任，王叔铭任空军总司令，桂永清仍任水兵总司令，黄镇球再任联勤总司令，另选孙立人任陆军总司令兼台湾防卫总司令并晋升为陆军二级大将。但孙却持续佩带陆军中将徽章，回绝在他的司令部升大将旗、在座车上悬挂大将标饰。蒋介石问他为何需求这样做，他说：“咱们已退守海岛，何功可言，何颜晋级。请比及回到大陆后再给我晋级吧!”蒋介石听到孙的这几句话感到很快乐，频频点头，面露笑脸地连声说：“好!好!”直到1950年7月31日麦克阿瑟拜访台湾时，蒋介石指令周至柔、孙立人担任招待，规则他们佩带大将徽章（周是陆军一级大将），这时孙立人才榜首次佩带大将的领肩章。

  孙立人是一位赋有爱国心的武士，但他在戎行里却常常遭到架空。在台湾时，他依然遭到陈诚左右那些人的轻视和嫉妒，境况也很险峻。若不是蒋经国同陈诚的对立逐渐加重，蒋经国又极力保护孙立人，蒋介石对孙尚要借势，恐怕孙立人不光当不上陆军总司令，并且早就遭受废黜了。

  1949年5月13日下午，上海西北郊月浦、狮子林的战役方完毕，蒋经国、邓文仪、张道藩、谷正纲、雷震等匆忙来到月浦五十二军二九六师阵地观察，向守军宣达蒋介石的慰劳嘉奖之意。其时，蒋经国在同军长刘玉章、师长刘梓皋和我的谈话中，对戎行里派系排挤的现象，极为气愤，痛斥一些高档指挥官的新军阀作风。但他对胡琏和孙立人却很欣赏，特别对孙立人有好感。他说：“孙弘毅（孙的别号）受过美国教育，更有中国人的气质，他立身正派，品性忠厚，重道义，讲时令，有胆略，有才十，超然于派系之外，明哲保身，刚正不阿，可与共祸患。他曾恳求恢复新六军，总裁也早已同意，国防部却两面三刀，久拖不办，坐失机遇，真实憎恶。”

  同年6月初，行政院长兼国防部长阎锡山，曾隐秘由广州来到台湾，在高雄寿山上同蒋介石、陈诚密谈竟日，决议建立东南军政长官公署，由陈诚任长官，罗卓英、王东原副之，肖毅肃任顾问长，车藩如任秘书长，吴国桢任台湾省主席。他们研讨关于台湾军事指挥机构的设置和人事安排问题时，曾在陈诚、蒋经国间发生了初次的直接抵触。其时陈诚是台湾省主席兼台湾警备总司令，担任“警总”实践在做的作业的是副总司令彭孟缉。孙立人名为陆军练习司令官，实践上只管第四军官练习班的干部练习和第六军、八十军的部队练习，并无指挥部队的权利。那时陈诚采用彭孟缉的主张，向蒋介石提出：“保存台湾警备总司令部，由彭孟缉任总司令，统率台湾的军、宪、警，担任台、澎区域的治安和守备。”蒋经国却向蒋介石主张：“吊销台湾‘警总’，建立台湾保安司令部，由彭孟缉任司令，专管治安；另设台湾防卫司令部，由孙立人任司令宫，统率台湾的戎行，履行捍卫台、澎区域的作战使命。”蒋经国还说：“在大陆上的失利，主要是戎行有派系。孙立人忠诚可靠，没有小团体，可以信赖。”蒋介石重复酌量，结果实行了蒋经国的主张，于1949年6月10日，召陈诚和孙立人比及高雄寿山，宣告关于人事安排的决议，6月20日由阎锡山下达正式录用。因此引起陈诚、彭孟缉对蒋经国和孙立人大为不满。不多，“朱谌之案子”爆发，顾问次长吴石和孙立人的军法处长周某，均被彭孟缉处死，连孙的随从顾问和孙的夫人张晶英的干女儿也遭拘捕。适蒋经国任“资料室”主任和政治部主任后，才获准开释。

  孙立人历来关怀官兵日子，重视体育和战役练习，常常到连队深化前沿阵地，同官兵一道日子，参与部队的练习和施工。他规则部队要种菜养猪办合作社，极力改进官兵日子，并要求前沿部队在沿海地带栽培3-5公里的防风林带，以掩蔽防御工事，改进台湾的植被状况，深受官兵和当地公民的赞赏。蒋介石亲临

  其时，台湾能当陆军总司令的人有黄杰、刘安棋、胡琏和彭孟缉。但黄杰在越南富国岛，一时不能回台，期望不大；只要胡琏的呼声最高，而彭孟缉却在幕内拼命钻营。无法蒋介石想借势孙立人同美国人的前史渊源，力求改进他同杜鲁门政府的联系，兼之蒋经国又从旁力荐，孙立人就出其不意地当上了陆军总司令，使陈诚、彭孟缉大为动火。蒋经国同陈诚、彭孟缉也就进一步结怨了。陈诚不甘示弱，数年之后，竟把彭孟缉推上了权势凌驾于国防部长之上的顾问总长的宝座。后来孙立人被黜，实则肇因于此。不过，蒋经国历来对孙立人既是那样信赖和器重，又是那样不吝开脱于陈诚、彭孟缉，而对孙极力保护；何故，后来当孙氏被诬紫害之时，蒋经国竟未能狗仗人势，为孙氏辩冤，徒令孙氏蒙冤受屈达多么之久，个中原委，颇为费解。诚不知何日方能真相大白，免除世人之疑窦。

  “仁安羌大捷”前史线.中英签署协议达到在缅甸战区的军事同盟。但英人忧虑中国戎行入缅动摇了英国殖民地蛋糕，再三阻遏我军越境。而坐等悠远的澳大利亚派兵不至。再三贻误战机，1942.02.缅甸英军与日军一触即溃，丘吉尔无法放我军入缅救火。原本的中英盟军联合抗日，演变为我军孤军作战，保护英国人溃逃。 1942.04.仁安羌油田危如累卵。04.15.应英军印缅战区总司令亚历山大的再三电告恳求，蒋介石发布指令：着远征军司令长官罗卓英敏捷集结军力，顶替英军西线防务，保护英军撤离。按军令部次长兼长官部顾问团团长林蔚的过错剖析敌情，仁安羌围住英军的日军军力约600人，设防单薄，其实是3000多鬼子。04.16.罗卓英就近抽调新38师113团刘放吾部进占巧克伯当，援助英缅榜首师，以112团陈鸣人部援助英缅第17师。以孙立人率新38师余部持续卫戍曼德勒。注：孙立人在仁安羌大捷期间寸步未离曼德勒！也没“电令”指挥过刘放吾团。